Basi molecolari della poliendocrinopatia autoimmune di tipoI: studi funzionali e strutturali sul dominio PHD finger della proteina AIRE
- 5 Anni 2008/2013
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La poliendocrinopatia autoimmune di tipo I (APECED) è una rara malattia autosomica recessiva caratterizzata da fenomeni autoimmuni diretti principalmente contro il sistema endocrino. La sindrome si manifesta con candidiasi muco-cutanee, ipoparatiroidismo autoimmune, malattia di Addison e insufficienza gonadica. Nonostante i progressi nelle terapie i pazienti hanno una bassa qualità di vita ed un'aspettativa di vita estremamente ridotta. La malattia è causata da mutazioni (puntiformi o delezioni) nel gene regolatore autoimmune AIRE che codifica per la proteina AIRE (~600 aminoacidi) la cui funzione è tuttora poco chiara. Abbiamo recentemente dimostrato che AIRE funziona come attivatore di trascrizione associandosi direttamente alla proteina istone H3, tramite un meccanismo che sinora non era stato mai descritto e che coinvolge una porzione di AIRE denominata PHD finger. I dettagli molecolari di tale meccanismo son tuttora sconosciuti Obiettivo del progetto è la caratterizzazione a livello atomico tramite risonanza magnetica nucleare dell'interazione tra AIRE-PHD1 e una porzione dell'istone H3. E' noto inoltre che mutazioni all'interno di AIRE-PHD1 causano APECED, il nostro obiettivo è¨ quindi di caratterizzare l'effetto di tali mutazioni nell'interazione con H3. La funzione di una proteina è strettamente legata ai suoi interattori. Al momento sono noti solo pochissimi interattori di AIRE, obiettivo di questo progetto è di identificare ligandi di AIRE tramiti metodi proteomici e di caratterizzare a livello atomico tali interazioni. Obiettivo ultimo del progetto è di chiarire ulteriormente sia la funzione di AIRE che il suo ruolo nella patogenesi di APECED.
Pubblicazioni Scientifiche
- 2015-03-01 ACS CHEMICAL BIOLOGY 
Structure-Based Design of a B Cell Antigen from B. pseudomallei
 - 2014-08-01 AMERICAN JOURNAL OF MEDICAL GENETICS PART A 
Identification of a Novel de Novo Deletion in RAF1 Associated With Biventricular Hypertrophy in Noonan Syndrome
 - 2010-01-01 ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION 
2D TR-NOESY Experiments Interrogate and Rank Ligand-Receptor Interactions in Living Human Cancer Cells
 - 2011-01-01 ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION 
Use of Metadynamics in the Design of isoDGR-Based ανβ3 Antagonists To Fine-Tune the Conformational Ensemble
 - 2012-01-01 ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION 
Molecular Dynamics Reveal that isoDGR-Containing Cyclopeptides Are True αvβ3 Antagonists Unable To Promote Integrin Allostery and Activation
 - 2014-02-01 BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-MOLECULAR BASIS OF DISEASE 
The biophysical and biochemical properties of the autoimmune regulator (AIRE) protein
 - 2013-12-01 BIOCHIMIE 
The stem cell secretome and its role in brain repair
 - 2011-03-15 BIOINFORMATICS 
The CCPN Metabolomics Project: a fast protocol for metabolite identification by 2D-NMR
 - 2014-04-01 BIOMOLECULAR NMR ASSIGNMENTS 
1H, 13C, 15N backbone and side chain NMR resonance assignments of BPSL1050 from Burkholderia pseudomallei
 - 2008-06-15 BLOOD 
Structural and functional effects of hereditary hemolytic anemia-associated point mutations in the alpha spectrin tetramer site
 - 2008-05-05 CHEMICAL PHYSICS LETTERS 
The binding domain of the HMGB1 inhibitor carbenoxolone: Theory and experiment
 - 2011-05-02 CHEMISTRY-AN ASIAN JOURNAL 
HMGB1-Carbenoxolone Interactions: Dynamics Insights from Combined Nuclear Magnetic Resonance and Molecular Dynamics
 - 2008-11-01 EPIGENETICS 
PHD finger of autoimmune regulator An epigenetic link between the histone modifications and tissue-specific antigen expression in thymus
 - 2014-01-01 FEBS JOURNAL 
Structure of human Sp140 PHD finger: an atypical fold interacting with Pin1
 - 2008-07-11 JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 
Structural basis for the interaction of isoDGR with the RGD-binding site of αvβ3 integrin
 - 2014-02-07 JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 
Oxidation-induced Structural Changes of Ceruloplasmin Foster NGR Motif Deamidation That Promotes Integrin Binding and Signaling
 - 2015-04-01 JOURNAL OF CELLULAR AND MOLECULAR MEDICINE 
Identification of TMPRSS6 cleavage sites of hemojuvelin
 - 2015-01-01 JOURNAL OF IMMUNOLOGY RESEARCH 
SP140L, an Evolutionarily Recent Member of the SP100 Family, Is an Autoantigen in Primary Biliary Cirrhosis
 - 2011-09-01 JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH 
Metabolomics of B to Plasma Cell Differentiation
 - 2012-12-01 NUCLEIC ACIDS RESEARCH 
AIRE-PHD fingers are structural hubs to maintain the integrity of chromatin-associated interactome
 - 2015-05-26 NUCLEIC ACIDS RESEARCH 
The ribonuclease DIS3 promotes let-7 miRNA maturation by degrading the pluripotency factor LIN28B mRNA
 - 2009-05-01 NUCLEIC ACIDS RESEARCH 
The solution structure of the first PHD finger of autoimmune regulator in complex with non-modified histone H3 tail reveals the antagonistic role of H3R2 methylation
 - 2012-10-15 PLOS ONE 
Exploring PHD Fingers and H3K4me0 Interactions with Molecular Dynamics Simulations and Binding Free Energy Calculations: AIRE-PHD1, a Comparative Study
 - 2014-01-01 PROTEIN CONFORMATIONAL DYNAMICS 
NMR and Computational Methods in the Structural and Dynamic Characterization of Ligand-Receptor Interactions
 - 2013-11-01 STROKE 
Safety and Efficacy of Transcranial Direct Current Stimulation in Acute Experimental Ischemic Stroke