Estrazione dati per l’analisi dei microarrays a DNA
- 3 Anni 2004/2007
 - 125.000€ Totale Fondi
 
Le due applicazioni della nuova tecnologia dei microarrays a DNA, profili d'espressione ed array CGH, permettono la generazione di enormi quantita' di dati genetici relativi a malattie ereditarie umane. L'effettiva e completa comprensione di tali moli di dati richiede l'impiego di calcolatori elettronici e programmi adatti per estrarre i dati ed interpretarne il significato. Inoltre e' particolarmente impegnativa anche la gestione dei dati . A tal fine sono necessarie banche dati specializzate, che consentano anche il trasferimento dei dati in formati standard da e verso programmi di analisi. Inoltre nonostante molti pacchetti applicativi di analisi siano stati messi a punto recentemente, vi sono ancora ampi spazi inesplorati. Il nostro servizio fornisce ai ricercatori che compiono esperimenti di DNA microarrays tutto il supporto necessario per giungere ad un pieno utilizzo delle informazioni contenute negli esperimenti. Inoltre il ricercatore puo' utilizzare ilservizio anche per il mantenimento dei dati su supporto digitale e per la pubblicazione via WWW. Infine, abbiamo messo a punto un software proprietario che permette ai ricercatori di mettere in relazione i risultati dei microarrays alle funzioni della cellula coinvolte nelle malattie ereditarie, con le relative valutazioni statistiche. E un altro pacchetto applicativo consente al ricercatore di capire dove sulla mappa del genoma umano siano localizzate le funzioni effettivamente alterate. In tal modo viene accelerata la fase di scoperta di nuovi geni responsabili per malattie ereditarie umane.
Pubblicazioni Scientifiche
- 2007-10-15 BIOINFORMATICS 
FunCo: identification of key functional differences in transcriptomes
 - 2008-02-01 BIOINFORMATICS 
TOM:: enhancement and extension of a tool suite for in silico approaches to multigenic hereditary disorders
 - 2006-01-09 BMC BIOINFORMATICS 
Finding biological process modifications in cancer tissues by mining gene expression correlations
 - 2007-11-23 BMC BIOTECHNOLOGY 
Compatible solutes from hyperthermophiles improve the quality of DNA microarrays
 - 2008-03-01 CANCER CELL 
E2F1-regulated microRNAs impair TGFβ-dependent cell-cycle arrest and apoptosis in gastric cancer
 - 2010-10-19 CANCER CELL 
Downregulation of p53-inducible microRNAs 192, 194, and 215 Impairs the p53/MDM2 Autoregulatory Loop in Multiple Myeloma Development (Retracted article. See vol. 40, pg. 1442, 2022)
 - 2006-06-01 DNA AND CELL BIOLOGY 
Microarray and large-scale in silico-based identification of genes functionally related to Haptoglobin and/or Hemopexin
 - 2005-02-01 HEAD AND NECK-JOURNAL FOR THE SCIENCES AND SPECIALTIES OF THE HEAD AND NECK 
Akt, protein kinase C, and mitogen-activated protein kinase phosphorylation status in head and neck squamous cell carcinoma
 - 2003-07-01 JOURNAL OF DENTAL RESEARCH 
Genetic expression profiling of six odontogenic tumors
 - 2002-05-01 MOLECULAR CANCER THERAPEUTICS 
Identification of differentially expressed genes in human salivary gland tumors by DNA microarrays
 - 2006-07-01 NUCLEIC ACIDS RESEARCH 
TOM: a web-based integrated approach for identification of candidate disease genes
 - 2006-05-01 ONCOGENE 
Fhit modulation of the Akt-survivin pathway in lung cancer cells: Fhit-tyrosine 114 (Y114) is essential
 - 2010-06-22 PLOS ONE 
Selected MicroRNAs Define Cell Fate Determination of Murine Central Memory CD8 T Cells
 - 2006-02-01 PRENATAL DIAGNOSIS 
Evidence of genetic underexpression in chorionic villi samples of euploid fetuses with increased nuchal translucency at 10-11 weeks' gestation
 - 2006-02-14 PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 
A microRNA expression signature of human solid tumors defines cancer gene targets
 - 2006-06-01 THEORETICAL MEDICINE AND BIOETHICS 
"More on respect for embryos and potentiality:: Does respect for embryos entail respect for in vitro embryos?"